ಪ್ರತಿದಿನ, ನಿಮ್ಮ ಜೀರ್ಣಾಂಗ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯಲ್ಲಿ ವಾಸಿಸುವ ಶತಕೋಟಿ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳು ಬದಲಾಗುತ್ತವೆ; ನೀವು ತಿನ್ನುವ ಆಹಾರ, ನೀವು ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳುವ ಔಷಧಿಗಳು ಮತ್ತು ಸೂಕ್ಷ್ಮಾಣುಜೀವಿಗಳು ಕೆಲವು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳನ್ನು ಇತರರಿಗಿಂತ ಹೆಚ್ಚು ಪ್ರವರ್ಧಮಾನಕ್ಕೆ ತರುತ್ತವೆ. ಕರುಳಿನ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಗಳ ಈ ನಿರಂತರವಾಗಿ ಬದಲಾಗುತ್ತಿರುವ ಸಮತೋಲನವು ನಿಮ್ಮ ಆರೋಗ್ಯ ಮತ್ತು ಕಾಯಿಲೆಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದೆ ಎಂದು ವಿಜ್ಞಾನಿಗಳು ತಿಳಿದಿದ್ದಾರೆ, ಆದರೆ ಒಂದು ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಸಮತೋಲನವನ್ನು ಇನ್ನೊಂದಕ್ಕಿಂತ ಉತ್ತಮವಾಗಿಸುವುದನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ಹೆಣಗಾಡಿದ್ದಾರೆ.
ಕಳೆದ ದಶಕದಲ್ಲಿ, ವಿಜ್ಞಾನಿಗಳು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ವ್ಯಕ್ತಿಯ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯನ್ನು ವಿವರಿಸಿದ್ದಾರೆ - ಮಾನವನ ಕರುಳಿನಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಗಳ ಸಂಗ್ರಹ - ಯಾವ ಜಾತಿಯ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳು ಇರುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಯಾವ ಪ್ರಮಾಣದಲ್ಲಿವೆ ಎಂಬುದನ್ನು ನಿರೂಪಿಸುವ ಮೂಲಕ. ಈಗ, ಗ್ಲಾಡ್‌ಸ್ಟೋನ್ ಇನ್‌ಸ್ಟಿಟ್ಯೂಟ್‌ನಲ್ಲಿ ಕೇಟೀ ಪೊಲಾರ್ಡ್, ಪಿಎಚ್‌ಡಿ ನೇತೃತ್ವದ ಸಂಶೋಧಕರ ಗುಂಪು ಎರಡು ಹೊಸ ಅಧ್ಯಯನಗಳನ್ನು ಪ್ರಕಟಿಸಿದೆ, ಅದು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ತಳಿಗಳನ್ನು ಮೇಲ್ವಿಚಾರಣೆ ಮಾಡಲು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ - ಮತ್ತು ಕೇವಲ ಜಾತಿಗಳು - ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಬಗ್ಗೆ ಉತ್ತಮ ಒಳನೋಟಗಳನ್ನು ನೀಡಬಹುದು.
ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ತಳಿಗಳು ಸ್ವಲ್ಪ ನಾಯಿ ತಳಿಗಳು ಅಥವಾ ಟೊಮೆಟೊ ಪ್ರಭೇದಗಳಂತೆಯೇ ಇರುತ್ತವೆ-ಒಂದೇ ಜಾತಿಯ ಭಾಗಗಳು, ಆದರೆ ಪರಸ್ಪರ ಭಿನ್ನವಾಗಿರುತ್ತವೆ.
ನೇಚರ್ ಬಯೋಟೆಕ್ನಾಲಜಿ ಜರ್ನಲ್‌ನಲ್ಲಿ ಪ್ರಕಟವಾದ ಒಂದು ಅಧ್ಯಯನದಲ್ಲಿ, ಪೊಲಾರ್ಡ್‌ನ ಪ್ರಯೋಗಾಲಯವು ಯುಎಸ್ ಡಿಪಾರ್ಟ್‌ಮೆಂಟ್ ಆಫ್ ಎನರ್ಜಿ ಜಾಯಿಂಟ್ ಜೀನೋಮ್ ಇನ್‌ಸ್ಟಿಟ್ಯೂಟ್‌ನ ಸಂಶೋಧನಾ ವಿಜ್ಞಾನಿ ಸ್ಟೀಫನ್ ನೈಫಾಚ್, ಪಿಎಚ್‌ಡಿ ಅವರೊಂದಿಗೆ ಮೈಕ್ರೋಬಯೋಮ್ ಮಾದರಿಯಲ್ಲಿ ಇರುವ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ತಳಿಗಳನ್ನು ವಿಶ್ಲೇಷಿಸಲು ಹೊಸ ಕಂಪ್ಯೂಟೇಶನಲ್ ವಿಧಾನವನ್ನು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಲು ಕೆಲಸ ಮಾಡಿದೆ. ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿರುವ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನಗಳಿಗಿಂತ ಹೆಚ್ಚು ತ್ವರಿತವಾಗಿ ಮತ್ತು ಕೈಗೆಟುಕುವ ದರದಲ್ಲಿ. ಹೊಸ ವಿಧಾನವು, ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಬಗ್ಗೆ ಹಿಂದೆಂದಿಗಿಂತಲೂ ದೊಡ್ಡ ಮತ್ತು ಹೆಚ್ಚು ನಿಖರವಾದ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳನ್ನು ಕೈಗೊಳ್ಳಲು ಸಂಶೋಧಕರಿಗೆ ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ ಎಂದು ಪೊಲಾರ್ಡ್ ಹೇಳುತ್ತಾರೆ.
ಜೀನೋಮ್ ರಿಸರ್ಚ್‌ನಲ್ಲಿ ಆನ್‌ಲೈನ್‌ನಲ್ಲಿ ಪ್ರಕಟವಾದ ಪ್ರತ್ಯೇಕ ಪತ್ರಿಕೆಯಲ್ಲಿ, ಪೊಲಾರ್ಡ್ ಸ್ಟ್ಯಾನ್‌ಫೋರ್ಡ್ ವಿಶ್ವವಿದ್ಯಾಲಯದಲ್ಲಿ ಬೆಂಜಮಿನ್ ಗುಡ್, ಪಿಎಚ್‌ಡಿ ಮತ್ತು ಮೈಕೆಲ್ ಸ್ನೈಡರ್, ಪಿಎಚ್‌ಡಿ ಅವರ ಲ್ಯಾಬ್‌ಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಹಕರಿಸಿದರು, ಒಬ್ಬ ವ್ಯಕ್ತಿಯ ಮೈಕ್ರೋಬಯೋಮ್‌ನಲ್ಲಿ 19 ವಿಭಿನ್ನ ಸಮಯದ ಬಿಂದುಗಳಲ್ಲಿ 5- ವರೆಗೆ ಇರುವ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ತಳಿಗಳನ್ನು ಪತ್ತೆಹಚ್ಚಲು. ಪ್ರತಿಜೀವಕಗಳ ಕೋರ್ಸ್ ಮೊದಲು ಮತ್ತು ನಂತರ ಸೇರಿದಂತೆ ತಿಂಗಳ ಅವಧಿ. ಕೆಲವು ಸಂದರ್ಭಗಳಲ್ಲಿ, ಸಮಯದ ಬಿಂದುಗಳ ನಡುವೆ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಜಾತಿಯ ಸಮೃದ್ಧತೆಯು ಸ್ಥಿರವಾಗಿರುತ್ತದೆ ಎಂದು ಅವರು ಕಂಡುಕೊಂಡರು, ಆದರೆ ಆ ಜಾತಿಯೊಳಗಿನ ತಳಿಗಳು ನಾಟಕೀಯವಾಗಿ ಬದಲಾಗುತ್ತವೆ.
ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಗಳನ್ನು ಅರ್ಥಪೂರ್ಣಗೊಳಿಸುವುದು
ನಿಮ್ಮ ಕರುಳಿನ ಒಳಗೆ, ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ ಬಹುಶಃ ನಿಮ್ಮ ಆಹಾರವನ್ನು ಜೀರ್ಣಿಸಿಕೊಳ್ಳುವುದಕ್ಕಿಂತ ಹೆಚ್ಚಿನದನ್ನು ಮಾಡುತ್ತದೆ. ವಾಸ್ತವವಾಗಿ, ಉರಿಯೂತದ ಕರುಳಿನ ಕಾಯಿಲೆ, ಆಸ್ತಮಾ, ಸ್ವಲೀನತೆ, ಮಧುಮೇಹ ಮತ್ತು ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ನಂತಹ ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ರೋಗಗಳಿರುವ ಜನರು ತಮ್ಮ ಜೀರ್ಣಾಂಗ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯಲ್ಲಿ ಆರೋಗ್ಯಕರ ಜನರಿಗೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ ವಿಭಿನ್ನ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದ್ದಾರೆ ಎಂದು ಅಧ್ಯಯನಗಳು ತೋರಿಸಿವೆ. ಆದರೆ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯನ್ನು ಗುರಿಯಾಗಿಸಿಕೊಂಡು ಕೆಲವು ಚಿಕಿತ್ಸೆಗಳು ಇಲ್ಲಿಯವರೆಗೆ ಈ ಅವಲೋಕನಗಳಿಂದ ಹೊರಹೊಮ್ಮಿವೆ.
ಪ್ರತಿಯೊಂದು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಂ ತನ್ನದೇ ಆದ ಆನುವಂಶಿಕ ಸಂಕೇತವನ್ನು ಹೊಂದಿರುವುದರಿಂದ, ಯಾವುದೇ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ವ್ಯಕ್ತಿಯ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಗಳಲ್ಲಿ ಯಾವ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳು ವಾಸಿಸುತ್ತವೆ ಎಂಬುದನ್ನು ಪತ್ತೆಹಚ್ಚಲು ವಿಜ್ಞಾನಿಗಳು DNA ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಅವಲಂಬಿಸಿದ್ದಾರೆ. ಆದರೆ ದತ್ತಾಂಶದ ಗಾತ್ರ ಮತ್ತು ಸಂಕೀರ್ಣತೆಯಿಂದಾಗಿ DNA ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ವಿಶ್ಲೇಷಿಸುವುದು ಕಷ್ಟ. ಸಂಶೋಧಕರು ಯಾವ ಜಾತಿಗಳು ಇರುತ್ತವೆ ಎಂಬುದನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸಲು ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿರುವ ವಿಧಾನಗಳನ್ನು ಬಳಸಬಹುದಾದರೂ, ಇವು ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ವೈವಿಧ್ಯತೆ ಮತ್ತು ಕಾರ್ಯದ ಚಿತ್ರದ ಭಾಗವನ್ನು ಮಾತ್ರ ಒದಗಿಸುತ್ತವೆ. ಏಕೆಂದರೆ ಒಂದೇ ಜಾತಿಯ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದಲ್ಲಿನ ವಿಭಿನ್ನ ತಳಿಗಳು ಗಮನಾರ್ಹವಾದ ಆನುವಂಶಿಕ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರಬಹುದು, ಅವುಗಳು ವಿಭಿನ್ನ ನಡವಳಿಕೆಗಳನ್ನು ಪ್ರೇರೇಪಿಸುವಷ್ಟು ದೊಡ್ಡದಾಗಿರುತ್ತವೆ.
ಇಲ್ಲಿಯವರೆಗೆ, ಮೈಕ್ರೋಬಯೋಮ್ ಮಾದರಿಯಲ್ಲಿನ ಆನುವಂಶಿಕ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ಹೆಚ್ಚಿನ-ಕಾರ್ಯಕ್ಷಮತೆಯ ಕಂಪ್ಯೂಟಿಂಗ್ ಪವರ್ ಮತ್ತು ಕ್ಲೌಡ್ ಸ್ಟೋರೇಜ್ ಅಗತ್ಯವಿರುತ್ತದೆ-ಇದು ಹೆಚ್ಚಿನ ಲ್ಯಾಬ್‌ಗಳಿಗೆ ಲಭ್ಯವಿಲ್ಲ. ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಗಳಲ್ಲಿ ಇರುವ ಸಾವಿರಾರು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳ ಜೀನೋಮ್‌ಗಳಿಂದ ಲಕ್ಷಾಂತರ DNA ತುಣುಕುಗಳನ್ನು ಸಂಶೋಧಕರು ಪ್ರತಿ ತಿಳಿದಿರುವ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಗಳ ಅನುಕ್ರಮಗಳೊಂದಿಗೆ ಡೇಟಾಬೇಸ್‌ಗೆ ಹೋಲಿಸಬೇಕಾಗಿತ್ತು, ಇದನ್ನು ಅನುಕ್ರಮ ಜೋಡಣೆ ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ.
ಪೊಲಾರ್ಡ್ ಮತ್ತು ಅವರ ಸಹೋದ್ಯೋಗಿಗಳು ಅನೇಕ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಜಾತಿಗಳು ಅಥವಾ ತಳಿಗಳಲ್ಲಿ ಜೀನೋಮ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳ ದೀರ್ಘಾವಧಿಯು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿದೆ ಎಂದು ತಿಳಿದಿದ್ದರು. ಆದ್ದರಿಂದ, ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಸ್ಟ್ರೈನ್ ಅನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ಸಹಾಯ ಮಾಡಲು ಈ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಬಳಸಲಾಗುವುದಿಲ್ಲ. ಮಾನವ ಜೀನೋಮ್‌ನ ಅತ್ಯಂತ ವೇರಿಯಬಲ್ ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು ಮಾತ್ರ ವಿಶ್ಲೇಷಿಸುವ ವಿಧಾನಗಳಿಂದ ಸ್ಫೂರ್ತಿ ಪಡೆದ ತಂಡವು ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ದತ್ತಾಂಶದಿಂದ ಯಾವ ತಳಿಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ ಎಂಬುದನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ಅಗತ್ಯವಿರುವ ಕನಿಷ್ಠ ಪ್ರಮಾಣದ ಅನುಕ್ರಮ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲು ಹೊರಟಿತು.
ಮಾನವನ ಕರುಳಿನಲ್ಲಿ ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಕಂಡುಬರುವ ಸರಿಸುಮಾರು 100,000 ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ ಪ್ರಭೇದಗಳಿಂದ 900 ಸಾರ್ವಜನಿಕವಾಗಿ ಲಭ್ಯವಿರುವ ಮತ್ತು ಉತ್ತಮ-ಗುಣಮಟ್ಟದ ಜೀನೋಮ್‌ಗಳನ್ನು ಸಂಶೋಧಕರು ವಿಶ್ಲೇಷಿಸಿದ್ದಾರೆ. ಅವರು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಜೀನೋಮ್‌ಗಳಲ್ಲಿ 104 ಮಿಲಿಯನ್ ಡಿಎನ್‌ಎ ಸಣ್ಣ ತಂತಿಗಳನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿದರು, ಅದು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ತಳಿಗಳ ನಡುವೆ ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ಬದಲಾಗುತ್ತದೆ. ನಂತರ, ಅವರು ಹೊಸ ಅಲ್ಗಾರಿದಮ್ ಅನ್ನು ವಿನ್ಯಾಸಗೊಳಿಸಲು ಈ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಬಳಸಿದರು, ಪ್ರೊಕಾರ್ಯೋಟ್‌ಗಳಿಗಾಗಿ ಜಿನೋಟೈಪರ್ (ಜಿಟಿ-ಪ್ರೊ) ಎಂದು ಕರೆಯುತ್ತಾರೆ, ಅದು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ತಳಿಗಳಿಗೆ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆಗಳಾಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುವ ಪ್ರಮುಖ ತಂತಿಗಳಿಗೆ ನಿಖರವಾದ ಹೊಂದಾಣಿಕೆಗಳಿಗಾಗಿ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿ ಅನುಕ್ರಮ ಡೇಟಾವನ್ನು ಹುಡುಕುತ್ತದೆ. ಹಿಂದಿನ ಅನುಕ್ರಮ ಜೋಡಣೆ ವಿಧಾನಗಳಿಗಿಂತ ಭಿನ್ನವಾಗಿ, ಜಿಟಿ-ಪ್ರೊ ಲ್ಯಾಪ್‌ಟಾಪ್‌ನ ಮೆಮೊರಿಗೆ ಹೊಂದಿಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಹೆಚ್ಚಿನ ಕಾರ್ಯಕ್ಷಮತೆಯ ಕಂಪ್ಯೂಟಿಂಗ್ ಮತ್ತು ಕ್ಲೌಡ್ ಕ್ರೆಡಿಟ್‌ಗಳ ಅಗತ್ಯವಿರುವುದಿಲ್ಲ.
ಪ್ರಪಂಚದಾದ್ಯಂತದ ಕೆಲವೇ ಲ್ಯಾಬ್‌ಗಳು ಸ್ಟ್ರೈನ್‌ಗಳ ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್‌ನಲ್ಲಿ ಮೈಕ್ರೋಬಯೋಮ್ ಡೇಟಾವನ್ನು ವಿಶ್ಲೇಷಿಸಲು ಹಣ ಅಥವಾ ಕಂಪ್ಯೂಟರ್ ಹಾರ್ಡ್‌ವೇರ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ ಎಂಬ ಅಂಶದಿಂದ ಈ ಹಿಂದೆ ಸಂಶೋಧನಾ ಕ್ಷೇತ್ರವನ್ನು ಸೀಮಿತಗೊಳಿಸಲಾಗಿದೆ.
ಪ್ರತಿಜೀವಕಗಳ ಮೊದಲು ಮತ್ತು ನಂತರ
ಮೈಕ್ರೋಬಯೋಮ್ ಸಂಶೋಧಕರು ಇತ್ತೀಚಿನ ವರ್ಷಗಳಲ್ಲಿ ಉತ್ತರಿಸಲು ಪ್ರಯತ್ನಿಸುತ್ತಿರುವ ಪ್ರಶ್ನೆಗಳಲ್ಲಿ ಒಂದು, ಕಾಲಾನಂತರದಲ್ಲಿ ಒಬ್ಬ ವ್ಯಕ್ತಿಯ ದೇಹದಲ್ಲಿ ಮೈಕ್ರೋಬಯೋಮ್ ಎಷ್ಟು ಬದಲಾಗುತ್ತದೆ ಎಂಬುದು. ಈ ಪ್ರಶ್ನೆಯನ್ನು ಜಾತಿಯ ಮಟ್ಟದಲ್ಲಿ ತಿಳಿಸಲಾಗಿದೆ; ಆಹಾರ, ರೋಗ, ಅಥವಾ ಪರಿಸರದ ಬದಲಾವಣೆಗಳೊಂದಿಗೆ ಜನರ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಗಳ ಜಾತಿಯ ಸಂಯೋಜನೆಯು ಹೇಗೆ ಬದಲಾಗುತ್ತದೆ ಎಂಬುದನ್ನು ವಿಜ್ಞಾನಿಗಳು ಟ್ರ್ಯಾಕ್ ಮಾಡಿದ್ದಾರೆ. ಆದರೆ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯು ಹೇಗೆ ಹೊಸ ಕಾರ್ಯಗಳನ್ನು ಪಡೆಯುತ್ತದೆ ಎಂಬುದನ್ನು ವಿವರಿಸಲು ಫಲಿತಾಂಶಗಳು ವಿಫಲವಾಗಿವೆ, ಉದಾಹರಣೆಗೆ ಪ್ರತಿಜೀವಕ ಪ್ರತಿರೋಧ ಅಥವಾ ಕಿಮೊಥೆರಪಿ ಔಷಧಿಗಳನ್ನು ನಿಷ್ಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುವ ಸಾಮರ್ಥ್ಯ, ಜಾತಿಯ ಸಂಯೋಜನೆಯು ತಿಂಗಳಿಂದ ತಿಂಗಳವರೆಗೆ ಸ್ಥಿರವಾಗಿರುತ್ತದೆ.
ಪೊಲಾರ್ಡ್ ಮತ್ತು ಅವರ ಸಹೋದ್ಯೋಗಿಗಳು ಈ ಪ್ರಶ್ನೆಯನ್ನು ಆಳವಾದ ಮಟ್ಟದಲ್ಲಿ ಪರಿಶೀಲಿಸಲು ಬಯಸಿದ್ದರು, ಕೇವಲ ಜಾತಿಗಳ ಬದಲಿಗೆ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ತಳಿಗಳು ಕಾಲಾನಂತರದಲ್ಲಿ ಹೇಗೆ ಬದಲಾಗುತ್ತವೆ ಎಂಬುದನ್ನು ವಿಶ್ಲೇಷಿಸುತ್ತಾರೆ. ಏಕ ಮಾನವ ಜೀವಕೋಶಗಳ ಅನುಕ್ರಮಕ್ಕಾಗಿ ವಿನ್ಯಾಸಗೊಳಿಸಲಾದ ವಿಧಾನವನ್ನು ಅವರು ಮರುರೂಪಿಸಿದರು ಮತ್ತು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ DNA ಅಣುಗಳನ್ನು ಬಾರ್‌ಕೋಡ್ ಮಾಡಲು ಬಳಸಿದರು. ಇದು 5 ತಿಂಗಳ ಅಧ್ಯಯನದ ಅವಧಿಯಲ್ಲಿ ಒಬ್ಬ ವ್ಯಕ್ತಿಯಲ್ಲಿ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಪ್ರತ್ಯೇಕ ತಳಿಗಳನ್ನು ಪತ್ತೆಹಚ್ಚಲು ಗುಂಪನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸಿತು.
ತಂಡವು ಆರೋಗ್ಯವಂತ ವ್ಯಕ್ತಿಯ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯನ್ನು ಸುಮಾರು 5 ತಿಂಗಳವರೆಗೆ ವಾರಕ್ಕೊಮ್ಮೆ ಅನುಕ್ರಮಗೊಳಿಸಿತು. ಆ ಸಮಯದಲ್ಲಿ, ವಿಷಯವು ಆಶ್ಚರ್ಯಕರವಾಗಿ ಲೈಮ್ ಕಾಯಿಲೆಯಿಂದ ಗುರುತಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿತು ಮತ್ತು 2 ವಾರಗಳ ಪ್ರತಿಜೀವಕಗಳ ಕೋರ್ಸ್ ಅನ್ನು ಪಡೆಯಿತು - ಮಾನವನ ಕರುಳಿನಲ್ಲಿ ವಾಸಿಸುವ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಂತೆ ಅನೇಕ ಜಾತಿಯ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳನ್ನು ತೊಡೆದುಹಾಕಲು ತಿಳಿದಿದೆ.
ಕೆಲವು ಸಂದರ್ಭಗಳಲ್ಲಿ, ಇದು ನಿಜವಾಗಿತ್ತು-ಕೆಲವು ಜಾತಿಗಳು ಮತ್ತು ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಗಳ ತಳಿಗಳು ಗಮನಾರ್ಹವಾಗಿ ಸ್ಥಿತಿಸ್ಥಾಪಕವಾಗಿದ್ದು, 5-ತಿಂಗಳ ಅವಧಿಯ ಪ್ರಾರಂಭ ಮತ್ತು ಮುಕ್ತಾಯದಲ್ಲಿ ಸುಮಾರು ಬದಲಾಗದ ಜೀನೋಮ್‌ಗಳೊಂದಿಗೆ ಇರುತ್ತವೆ. ಆದರೆ ಇತರ ಸಂದರ್ಭಗಳಲ್ಲಿ, ಪ್ರತಿಜೀವಕಗಳ ನಂತರ ಇರುವ ತಳಿಗಳು ತಳಿಗಳ ಸಮೃದ್ಧಿಯು ಬದಲಾಗದಿದ್ದರೂ ಸಹ ಆರಂಭದಲ್ಲಿದ್ದಕ್ಕಿಂತ ತಳೀಯವಾಗಿ ಭಿನ್ನವಾಗಿದೆ. ಮುಖ್ಯವಾಗಿ, ತಂಡವು ಪ್ರತಿ ಮೈಕ್ರೋಬಯೋಮ್ ಮಾದರಿಯಲ್ಲಿ ಇರುವ ಜಾತಿಗಳನ್ನು ಮಾತ್ರ ವಿಶ್ಲೇಷಿಸಿದ್ದರೆ ಈ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳು ತಪ್ಪಿಹೋಗುತ್ತವೆ.
ಈ ಅಧ್ಯಯನದಲ್ಲಿ ಬಳಸಲು GT-Pro ಅಲ್ಗಾರಿದಮ್ ಇನ್ನೂ ಲಭ್ಯವಿಲ್ಲದಿದ್ದರೂ, ಇದೇ ರೀತಿಯ ಭವಿಷ್ಯದ ಅಧ್ಯಯನಗಳನ್ನು ನಡೆಸುವುದು ಸುಲಭ ಮತ್ತು ಅಗ್ಗವಾಗಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ಪೊಲಾರ್ಡ್ ಹೇಳುತ್ತಾರೆ.
ಮೈಕ್ರೋಬಯೋಮ್ ಅಧ್ಯಯನಕ್ಕಾಗಿ ಹೊಸ ಮಾರ್ಗವನ್ನು ಪಟ್ಟಿ ಮಾಡುವುದು
ನಿಮ್ಮ ದೇಹದಲ್ಲಿನ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳು ಕಾಡಿನಂತೆ-ಜೀವಂತ, ಸೂಕ್ಷ್ಮ ಸಮತೋಲನದಲ್ಲಿ ಸಹ-ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿರುವ ಜೀವಿಗಳೊಂದಿಗೆ ಬದಲಾಗುತ್ತಿರುವ ಪರಿಸರ ವ್ಯವಸ್ಥೆ. ಮೇಲಿನಿಂದ ಉಪಗ್ರಹ ಚಿತ್ರಗಳನ್ನು ನೋಡುವಾಗ, ಪರಿಸರಶಾಸ್ತ್ರಜ್ಞರು ಕಾಡಿನಲ್ಲಿ ಅತ್ಯಂತ ಆಳವಾದ, ತೀವ್ರವಾದ ಬದಲಾವಣೆಗಳನ್ನು ಮೇಲ್ವಿಚಾರಣೆ ಮಾಡಬಹುದು, ಆದರೆ ಪರಿಸರವನ್ನು ರೂಪಿಸುವ ಸೂಕ್ಷ್ಮ ಜಟಿಲತೆಗಳನ್ನು ಅವರು ಕಳೆದುಕೊಳ್ಳುತ್ತಾರೆ.
ಅಂತೆಯೇ, ಜಾತಿಯ ಬದಲಾವಣೆಯನ್ನು ವೀಕ್ಷಿಸುವ ಮೂಲಕ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯನ್ನು ಅಧ್ಯಯನ ಮಾಡುವವರು ನೆಟ್‌ವರ್ಕ್‌ನ ಉನ್ನತ ಮಟ್ಟದ ನೋಟವನ್ನು ಪಡೆಯುತ್ತಿದ್ದಾರೆ ಮತ್ತು ಆರೋಗ್ಯ ಮತ್ತು ಕಾಯಿಲೆಗೆ ಅತ್ಯಂತ ಸ್ಪಷ್ಟವಾದ ಸಂಪರ್ಕಗಳನ್ನು ಮಾತ್ರ ನೋಡುತ್ತಿದ್ದಾರೆ. ಆದರೆ ಜಿಟಿ-ಪ್ರೊ ಮತ್ತು ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಗಳ ಹೊಸ ನೋಟದೊಂದಿಗೆ, ಹೊಸ ಲಿಂಕ್‌ಗಳು ಸ್ಪಷ್ಟವಾಗುತ್ತವೆ ಎಂದು ಪೊಲಾರ್ಡ್ ಹೇಳುತ್ತಾರೆ.
ಈ ಲೇಖನದಿಂದ ಏನು ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳಬೇಕು:
- In one study published in the journal Nature Biotechnology, Pollard’s lab worked with Stephen Nayfach, PhD, a research scientist at the US Department of Energy Joint Genome Institute, to develop a new computational method to analyze the strains of bacteria present in a microbiome sample much more quickly and affordably than existing technologies.
- In a separate paper published online in Genome Research, Pollard collaborated with the labs of Benjamin Good, PhD, and Michael Snyder, PhD, at Stanford University to track the strains of bacteria present in one person’s microbiome at 19 different time points over a 5-month period, including before and after a course of antibiotics.
- Researchers had to compare millions of DNA fragments from the genomes of thousands of bacteria present in the microbiome to a database with the sequences of every known microorganism, using a technique known as sequence alignment.
